不论从包装成本，还是性能要求任何一方面考虑，复合软包装材料各层的厚度选择是应认真权衡的。
一般来说，热封层可以通过市场通用化和标准化来确定，强度支持层一般根据被包装产品的重量确定，而功能材料的厚度一般由产品的货架寿命确定。理论上确定软包装复合材料厚度的方法本文阐述。
1、根据被包装产品的允许吸水量或允许脱水量确定
该方法主要适应产品的防潮包装设计，其关键是计算软包装复合材料的透湿系数。
2、根据被包装产品的允许氧气吸收量确定
该方法主要适合产品对氧气非常敏感的产品阻隔性包装，其关键是计算软包装复合材料的透氧系数。
3、根据单位体积或单位表面积允许微生物的数目确定
该方法主要适合产品对微生物非常敏感的防霉包装，其关键是确定产品微生物的种类及其繁殖生长的规律等。
4、根据包装容器允许的透二氧化碳量或透氧量确定
该方法主要针对产品的充气保险包装，具有声明活性的产品既需要氧气保险或保持鲜艳的色泽，又需要高浓度的二氧化碳来抑制微生物的生长繁殖，其关键是计算软包装复合材料的透氧系数和透二氧化碳系数。
产品包装时，有时候既要达到防潮包装的目的，又要达到阻氧包装或防霉包装的目的。因此，一般先以产品包装的某种主要包装目的和产品货架寿命确定复合包装材料的厚度，再根据材料的厚度和另一种包装目的估算所设计包装的理论保质期，来验证设计包装的合理性。