1996年，南京市私营企业联合党委成立，专职从事非公党建工作，开全国非公党建工作之先河。2014年底，工商管理体制改革后，市工商局私营企业联合党委职责调整为“负责配合党委组织部门开展有关私营企业、小微企业、个体工商户、专业市场的党建工作”，加挂“非公有制经济组织党建工作办公室”牌子，进一步强化了指导全市工商市场监管系统开展非公党建工作的职能和要求。
为健全非公党建新机制，每年年初，私企联合党委都定期召开会议，部署非公党建工作，组织培训，加强对全市非公党建工作的指导督查。他们启动建设了“党建e家”智慧党建项目，建立了党代表工作室，选配240名基层党组织书记，建立了41家非公党建联系点，建立非公党建QQ群、微信等平台，实现党委与基层支部、党员即时通信、无缝对接。
针对我市私营企业发展迅猛的特点，市工商局提出“私营企业发展到哪里，党建工作就延伸到哪里”的党建理念，在全市“小个专网”中深入推进非公党建“百千万”工程，创设“双培养、双深入”新措施，开展非公党建提质增效“百日攻坚行动”，依据企业年报党建信息开展“大走访”，对符合成立党组织条件的非公企业开展指导组建工作。
以党建带团建，自2016年南京市非公有制经济组织团工委成立以来，先后开展了多种形式的团建活动，目前已经建立团支部12家、团委1家。
市工商局私营企业联合党委还在全市非公企业党组织中开展了一系列丰富多彩的主题活动，包括“党旗飘扬”阳光工程、“双强六好”创建、“双十佳”和“党员示范岗”评比等，其中，“走千企入万户、助发展促富民”大走访活动，累计走访非公企业26家，实现“党员干部走下去，发展难题带上来”，推动了非公党建工作的有效开展和非公经济健康发展。私企联合党委先后被市委商务工委表彰为基层党组织考核特等奖，被市委表彰为南京市先进基层党组织，非公党建工作的经验被国家工商总局评选为“十大创新事例”，非公团建工作被团市委年度考核为。