冬虫夏草菌的子囊孢子为多细胞的针状物，由子囊散出后产生横隔，每段萌发，产生芽管，侵入昆虫的幼虫体内，蔓延发展，破坏虫体内部的结构，把虫体变成充满菌丝的僵虫，冬季形成菌核，夏季自幼虫体的头部长出棍棒状的子座，子座上端膨大，近表面生有许多子囊壳，壳内生有许多长形的子囊，每个子囊具2—8个子囊孢子，通常只有2个成熟，子囊孢子细长、有多数横隔，它从子囊壳孔口散射出去，又继续下一个周期的循环。
带未弹射子囊孢子的子座的虫形菌核即为药材冬虫夏草，含虫草酸等多种有益物质，能补肺益肾，止血化痰。 [2] 虫草属有130多种，我国有20多种，其中如蛹草菌、凉山虫草、亚香棒菌等，它们的带子座的菌核和冬虫夏草有相似的疗效，从蛹草菌的培养物中可得到虫草素。蝉花菌．带子座菌核能清热，镇惊明目。
然而正宗的冬虫夏草菌是中国被毛孢，也叫做蝙蝠蛾被毛孢，利用现代生物技术发酵生产的蝙蝠蛾被毛孢菌丝体有与冬虫夏草相近的作用，且价格只有冬虫夏草的十几分之一。
嗅之具草菇香气，味甘。足8对，中部4对较明显，质脆，易折断，断面黄白色。子座单生，细长圆柱形，长4至7厘米，直径约3毫米；表面深棕色至棕褐色，有细纵皱纹，上部稍膨大，质柔韧，断面类白色。气微腥，味微苦。以虫体色泽黄亮，丰满肥大，断面黄白色，子座短小者为佳。
由于精选标准没有量化，在此基础上面虫草专家引入了更高的量化的标准，即：无穿条、无断草、无瘪草、无死草、无混草、干度保持在95%以上，同时将饱满度较差的虫草挑出，形成的优质精选虫草即产地5A精选。市场上面产地5A精选虫草的典型代表是福临门冬虫夏草以及北京同仁堂冬虫夏草，前者性价比较好，天然虫草素含量以及天然氨基酸含量较高，适合居家自用；后者包装档次较好，价格比较高，适合节日送礼。