通常情况下报告的部门要根据你拆除厂房之前是属于什么行业是否有危险性，对应性判断一下再跟相关部门报告，通常拆迁是需要注销房产证的，厂房自行拆除的房屋办理房产注销的具体步骤如下：
1、是否符合城建规划和消防规范？此项不符合就需要向”规划局“报告
2、是否有国土规划和施工许可证？不符合就需要”国土局“报告
3、是否符合环保要求？不符合就需要”环保局“报告
4、以上三点不符合的就需要申请人为个人的，提供个人身份证明。证明房屋权灭失的材料及申请注销的《房屋权证》报告。
5、如属拆迁公司需提交《拆迁许可证》或拆迁公告等相关方书（需拆迁单位盖章或原件核对）。