以上两种银行保函办理方法的优势对比1，直接银行办理优点：乙方自主选择开具保函的银行，只需要少量的银行工本费，仅适合办理五万元以下或者对银行的保证责任较轻的履约保函。缺点：1客户自己去提交资料。2银行对保函格式的要求比较严格，如果保函格式索赔条款比较严格，让银行的赔付责任较重，银行审核很难通过。3银行出具保函需要客户存入同等金额的保证金，对客户来说并没有节省资金。2，第三方担保公司办理1 担保公司办理银行保函，只要项目真实有效，甲乙双方正常经营，保函办理难度都不大，保函格式的接纳度也更高。2 担保公司办理银行保函即可省出全部或者大部分保证金，客户只需要付给担保公司担保费即可（约2%，看具体项目增减），银行划扣担保公司额度。3 保证金何时退回？1 不管保函是否到期或工程完工，只需甲方将保函退回乙方，并且出具保函责任免除书面报告后可以退回保证金，或者超过保函有效期，保函自动失效。此上两种情况，乙方可以直接向银行申请解保，银行即可退回保证金至乙方。
保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。保证在申请人未能按双方协议履行起责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定期限范围内的某种支付责任或经济赔偿责任。 保函即为保证书，为了方便，船公司及银行都印有一定格式的保证书。其作用包括凭保函交付货物、凭保函签发清洁提单、凭保函倒签预借提单等。
银行保函对企业资质要求高，三级资质履约保函、纯采购项目履约保函、民工工资保函、质量保修保函，银行在出具银行保函过程中，要求缴纳保证金。商业保函和银行保函起到的法律效力相同，相同条件下，办理商业保函费用便宜，更加快捷灵活。
个人建议，如果您的项目，在一两个月的情况下就能完成，就跟甲方协调下，尽量别在开保函了，能给自己的企业节省一大笔费用，如果时间比较长，就需要开延期保函了，其实延期保函，就是重新开保函，跟上次出保函的流程时候一样的。
把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。